由于春节的关系，郑芝龙的军队在攻下苏州府，与公孙翊的军队在长江上打了几仗，皆没有讨到便宜，便没有再采取攻势。
镇守扬州港的水师提督李仲、霍岗，由于实力不足，见郑家军没有进攻，也没敢主动挑衅。
陆地方面由于李岩在松江遭到倭寇忍者的刺杀，导致意外暴毙，这才结果松江和苏州二府失守。
因为倭寇这次不单单只是针对李岩一人，护漕军中的几个总兵，王巨、孙霸、王弘来、徐忠彦、李时年五人先后中了倭人的招，皆死于倭寇的忍者之手。
八大总兵官五人死于意外，加上大帅李岩还死了，这直接导致十万护漕军差点分崩离析。
若不这支军队的核心是公孙翊一手创建的，基层军官多出自昔日永城讲武堂士官生，经此大乱的十万大军必然一遭会灰灰湮灭。
护漕军八大总兵官，仅剩下陈永福、容坦、沉华和行军司马宋奎光。
陈永福是员老将，作战经验丰富，容坦睿智多谋，沉华虽然年轻，却也是意志坚定，三人从松江且战且退，收拢了六万人马退守到常州。
与常州知府阎应龙汇合，这才稳准阵脚。
年前郑芝龙派其弟郑鸿逵，督率十五水路大军围攻常州，连战旬日，未能讨得半点便宜，眼看春节在即，大军这才退回松江休整。
而郑芝龙这个时候，已经把靖海侯府私宅，搬迁到临安府，眼下临安已经成为郑芝龙的政治中心。
1647年一月十五元宵佳节。
金陵城举城欢度佳节之日，被软禁在原来福王府内的朱由崧，被进京朝贺的江西巡抚瞿起田、会合南京六部之一的兵部左侍郎刘统。
金陵知府张捷、吏部侍郎谢升、都察院佥都御使刘宗周、以及在京的张良左、陈用极、王一斌等人秘密接出金陵。
十天之后，福王朱由崧便在临安府匆匆登基，昭告天下复辟之事，并大赦天下，同时宣告天下，讨伐公孙翊。
这封讨伐的檄文出自江南文坛领袖吴伟业，这檄文中，吴伟业把公孙翊声讨为乱臣贼子，窃国大盗，把他宣扬成为一个好色贪财，好杀无礼伪君子形象。
一时之间公孙翊的声望在江南士人心中，可谓一落千丈。
不过即便没有这篇檄文，公孙翊在江南士人眼中，也没有什么好的声望。
原因嘛，很简单，那就是他与江南文坛领袖钱谦益、吴伟业等人向来不睦。
正所谓政见不和，自然也就是敌人。
江西巡抚瞿起田这次这般卖力入南京，营救朱由崧出京，自然不是公孙翊得罪了他。
也不是因为两人有嫌隙，而是因为瞿起田是钱谦益的学生，他也东林党的中坚分子。
公孙翊在燕京改革官职，废除内阁大学士制度，成立内阁总理大臣制度，并昭告天下，科举并不是唯一出仕之路。
因为公孙翊推动贡生学院和讲武堂学院制度，只要经过这两所学院学习五年，顺利毕业者，只要通过吏部考核，皆可入仕。
这一项重大的改革，犹如当年隋炀帝开科举，打破豪门大族垄断官场的门户，自是引得人人攻讦。
江南士族官绅，他们早就结成无数的党派，几代人一直都是走科举出仕，姻亲，师生、党派，形成一道道无形的利益链。
也就是说他们基本上已经垄断大明官场的一半的新鲜血液，向东林党人当初在朝廷中的势力，一度甚至与皇权抗衡。
以至于天启皇帝登基后，不得不启用魏忠贤，大肆打压东林党人，企图肃清朝中所谓的东林党、楚党、浙党等层出不穷的党争之乱。
所以这次江南地区大乱，并不是公孙翊大意造成的，而是从他改革官制，改革入仕条件，就注定会把江南这批读书人推到对立面。
这是无法调和的矛盾，是有关生死的大争，必须要有一方倒下。
郑芝龙显然就是这些士族党人选出来的代言人，当然他们也自认为郑芝龙会跟他们站在一起。
甚至公孙翊的老师，黄道周对于公孙翊的改革，也颇有些微词，只是如今他与公孙翊一荣俱荣，这才没有站到公孙翊的对立面。
金陵的大乱，由于尽在迟尺的常州护漕军的存在，并没有引起引起巨变。
在接到消息的第二天，陈永福就派容坦率领两万人马，迅速进入金陵城中，稳住了金陵的局势。
金陵的六部尚书，皆不是东林党人士，虽然也曾被郑芝龙派人拉拢，但因为身居高位，加上燕京的皇帝尚在，倒也没有人附和生变。
南京锦衣卫指挥使骆养性，由于应变及时，并及时派人向常州的程永福发出求援信使，也是金陵没有巨变的关键。
正月二十五日，福王在临安府复辟，改元弘光元年，大封群臣。
郑家一门数人封侯，郑芝龙更是被封为靖海公、其弟郑鸿逵封为镇海候、郑森封为安平候。
同时郑芝龙被加封为太子太保、东阁大学士内阁首辅，水师总督。
吕大器封为文渊阁大学士、内阁次辅兼兵部尚书。
吴伟业封为东阁大学士、礼部尚书。
龚鼎孳封为东阁大学士、吏部尚书。
李邦华为文渊阁大学士、户部尚书。
瞿起田为文渊阁大学士、工部尚书。
王朝先为刑部尚书。
张肯堂为浙江巡抚，方国安为浙江总兵。
郑鸿逵为福建巡抚，熊汝霖为福建总兵。
张同敞接任江西巡抚，王桓为江西总兵。
一时复辟的福王新朝，人人加官进爵，声势之盛，江南半壁江山在握。
被封为安平华候的郑森，加封为广东总兵，准备以弘光皇帝朱由崧的名号，收两广之地为己用。江西巡抚瞿起田投入到弘光一朝，显然大大增加了郑芝龙的势力。
要知道江西行省，在江南地区的地位，在这个时代比起浙江承宣布政使司还要重要。
作为鱼米之乡的江西承宣布政使司，不但农业经济繁荣，同样地理位置也十分重要。
向北可以进攻江淮地区，向西可以进攻湖广之地，扼守鄱阳湖则可以为福建广东屏障。
朱由崧在临安复辟当天，公孙翊率领的大军，也终于抵达扬州府，这一天正是一六四七年的正月二十五日。
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